Estudio de marcadores genéticos relacionados con la calidad de la leche y sanidad de la ubre

Abstract

El programa de mejora genética de la raza Assaf utiliza como criterio de selección además de la producción de leche (PL), el porcentaje de proteína (PP) y porcentaje de grasa (PG), ambos relacionados con la calidad de la leche y el rendimiento quesero. Igualmente, desde una perspectiva de calidad higiénico-sanitaria, el Recuento de células somáticas (RCS) es un indicador de la salubridad de la ubre, y permite la eliminación precoz de animales con mamitis clínicas o subclínicas, pudiendo aplicar incentivos económicos en la venta. En el presente trabajo han sido estudiados factores genéticos relacionados con la producción y calidad de la leche, así como su calidad higiénico sanitaria en ovejas de raza Assaf, utilizando como estrategia análisis de asociación de genoma completo (GWAS) con plataformas de genotipado masivo de marcadores SNPs, y la posterior validación de resultados a través del genotipado en toda la población mediante KASP. En resumen, hemos identificado 2, 6, 3, 15, 25 y 5 SNPs asociados a los fenotipos PL, PP, PG, PL, (porcentaje de lactosa), ES (porcentaje de extracto seco), y RCS, respectivamente, mediante GWAS a nivel de significación cromosómica. De estos SNPs, 3 se han validado mediante estudios de asociación en toda la población de estudio, estando dos de ellos asociados al RCS (rs419096188 y rs424642424), en dos regiones del cromosoma OAR19 en la que están anotados genes relacionados con la respuesta inmune (NUP210, HDAC11 y ARPP21). Además, el SNP rs419096188 se ha asociado al CL, presentando una correlación negativa con el RCS, de forma que la selección a favor del genotipo AA produciría una disminución del RCS e incremento del CL. Finalmente, el SNP rs419686662 se ha asociado al PP, y se encuentra localizado cerca del gen FGFR2, que codifica para un receptor de factores de crecimiento fibroblástico que se han asociado con en el desarrollo y funcionalidad de la glándula mamaria en producción.