Desarrollo de un panel de SNPs para la asignación de paternidad aplicado a los programas de mejora y conservación de razas ovinas de carne del noreste de España
Date
2018
Authors
Calvo Lacosta, Jorge HugoSerrano, Mª Magdalena
Tortereau, F.
Sarto Aured, María Pilar
Jiménez, M.A.
Iguácel Quintana, Laura P.
Folch Pera, José
Alabart Alvarez, José Luis
Fabre, Stéphane
Lahoz Crespo, Belén
Journal Title
Journal ISSN
Volume Title
Publisher
Typology
Proceedings PaperArticle
Abstract
El objetivo de este trabajo fue el desarrollo de un panel de SNPs para la asignación de paternidad
a partir de los datos de genotipado obtenidos con el chip “Ovine SNP50 Bead Array
(50K)” en las razas Rasa Aragonesa, Navarra, Churra Tensina, Ansotana, Xisqueta, Roya Bilbilitana,
Maellana, Ojinegra y Cartera. Se seleccionaron un total de 159 SNPs en equilibrio
de Hardy-Weinberg, con una frecuencia del alelo menos común (MAF) superior a 0,3, un
porcentaje de individuos genotipados por SNP superior al 97% en las 9 razas analizadas, y que
presentasen herencia mendeliana. El MAF medio fue de 0,43, variando desde 0,41 (Churra
Tensina) hasta 0,44 (Xisqueta y Navarra). La probabilidad de identidad (Pi) de que dos individuos
elegidos al azar fueran idénticos para estos marcadores varió entre 8,81 × 10−67 (Cartera)
y 2,29 × 10−64 (Roya Bilbilitana). La probabilidad de exclusión de un solo progenitor (PE1),
o los dos progenitores (PE2) fue prácticamente 1 en todas las poblaciones. Finalmente, este
panel fue testado en las razas Rasa Aragonesa, Navarra, Ansotana y Cartera mediante tecnología
KASP usando un panel de 192 SNPs que incluyen los 159 SNPs para la asignación de
paternidad y 33 SNPs funcionales (PrnP, BMP15, MTNR1A…)
Description
Keywords
Bibliographic citation
XLIII Congreso Nacional y XIX Internacional de la Sociedad Española de Ovinotecnia y Caprinotecnia (SEOC). Zaragoza, 19 al 21 de septiembre de 2018
AGROVOC subjects
OvinosAnimales de carne
Mejora genética
Criterios de selección